Gracias por el interés mostrado en LanguageTool.
Sobre los acentos diacríticos, hay un hilo sobre el tema, en el que explico por qué algunos diacríticos, especialmente en pronombres relativos como los mencionados, están fuera del alcance de la herramienta en su estado actual.
Sin embargo, para casos en que inequívocamente deba utilizarse una u otra formas sí se podrían revisar o añadir reglas. En ese caso, por favor, necesito una descripción lo más formal posible de la regla a señalar. Un buen ejemplo para proponer mejoras es el de falla de corrección: “Sé”, Verbos “Ser” y “Saber”.